民眾對傳統大腸鏡檢查的恐懼，比起傳統胃鏡有過之而無不及。 傳統大腸鏡的不舒服，主因在於需要經常打入空氣把大腸撐開，讓大腸內膜更容易觀察。另外，大腸非直線，大腸鏡必需隨彎曲的腸道前進，從肛門進入，經直腸、乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸、盲腸直到闌尾，長度超過1公尺。傳統大腸鏡因為深入、轉彎、充氣，常會壓迫、牽扯、拉緊腸壁外層，讓民眾感覺想解便、腸子絞痛、腹脹等，承受比胃鏡更多的疼痛。
對於無痛內視鏡檢的安全性，曾在國內引起廣泛討論，長久以來，部分學界認為「痛是警訊」，認為無痛大腸鏡會提高腸穿孔機率。然而國內外的臨床應用經驗顯示，腸穿孔、併發症並未增加，反而降低民眾受檢時疼痛與不適感。 無痛內視鏡檢查(包含胃鏡與大腸鏡)之所以無痛，秘訣在藉由靜脈注射進行舒眠麻醉，讓病患的痛覺消失。使用的藥物主要以安眠藥物與止痛藥為主，此種麻醉方式又稱「舒眠麻醉」，屬安全性極高的淺層麻醉，約歷時20分鐘。
由於胃鏡與大腸鏡皆屬高度侵入性的檢查與治療，有很多民眾會產生極大的疼痛與不適，加上對於檢查的不確定性與異物在體內鑽動的恐懼，有些民眾甚至因而引發血壓升高、腦壓升高、心肺負荷增加等生理反應，增添內視鏡檢查的風險。因此，舒眠麻醉是絕佳的解決方案。
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